| 明治9年9月5日 (1876年) | 太政官布告により、薩摩の念仏 禁制が解けて信教自由となる。 |
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| 明治12年4月20日 (1879年) | 指宿説教所(通称 十二町説教所) 開設。 |
| 明治13年 (1880年) | 本堂建築着手 |
| 明治14年 (1881年) | 本堂落成 |
| 明治18年 (1885年) | 庫裡建築 |
| 明治23年 (1890年) | 藤岡大乗、十二町説教所に滞在布教。 |
| 明治24年 (1891年) | 藤岡大乗、十二町説教所の看守となる。 |
| 明治30年5月14日 (1897年) | 乗船寺と寺号公称 (初代住職 藤岡大乗、坊守ヨシヱ) |
| 明治40年6月22日 (1907年) | 藤岡道龍、乗船寺第二代住職となる。 (坊守・藤岡コマ) |
| 大正6年7月20日 (1917年) | 藤岡 (ボクジョウ)、乗船寺第三代住職となる。(坊守・藤岡幸糸) |
| 大正10年7月10日 (1921年) | 梵鐘曳揚げ式 (この梵鐘は戦時中供出をして遂に帰らなかった。) |
| 昭和7年 (1932年) | 乗船寺日曜学校幼稚部発足（乗船寺幼・保の前身） |
| 昭和17年 (1942年) | 梵鐘喚鐘をはじめ仏具を供出す |
| 昭和23年5月1日 (1948年) | 乗船寺保育園認可 |
| 昭和28年 (1953年) | 柳和園（現在の柳和幼稚園）の設立 準備をして、昭和29年4月開園 |
| 昭和29年2月28日 (1954年) | 住職継職法要。第四代住職藤岡義昭 (坊守・藤岡澪) |
| 昭和33年4月1日 (1958年) | 指宿幼稚園開園 |
| 昭和39年12月5日〜7日(1964年) | 宗祖親鸞聖人七百回大遠忌法要と 本堂落成慶讃法要を勤める。 |
| 昭和40年10月18日 (1965年) | 中村久子女史来寺 |
| 昭和51年5月7日 (1976年) | 社会福祉法人一子地福祉会の設立認可さる |
| 昭和51年5月9日 | さつま開教100年 仏教壮年大会(指宿市民会館) 大谷光真新門様(現門主)御出向 |
| 昭和53年2月10日 | 乗船寺保育園2階建て園舎完成 |
| 昭和54年11月17〜18日 (1979年) | 乗船寺開基百年記念法要 この年11月、指宿幼稚園2階建て園舎完成 10月門徒会館完成(指宿幼稚園のリズム室を移築) 鐘楼落成(肥後ヒロ氏より梵鐘の寄付を受けて建築、この年末より、除夜の鐘を打つ) |
| 昭和56年7月 (1981年) | 住居表示変更。 乗船寺は十二町1481から、湊一丁目11番22号となる |
| 昭和62年4月29日 (1987年) | 大谷光照前門様、乗船寺にご来訪 |
| 平成2年1月27日（1990年） | 藤岡義道、第五代住職となる（坊守・藤岡香代子） |
| 平成2年11月6日（1990年） | 内陣修復落成並びに住職継職法要 |
| 平成12年4月（2000年） | 第一納骨堂完成 |
| 平成15年8月（2003年） | 門徒会館及び庫裏改築完成 |
| 平成18年12月（2006年） | 鐘楼を曳移転し、跡地に第二納骨堂完成 |
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